在macOS上安装xlsx和rJava Mavericks 10.9.5

问题描述：

它是在我的Mac上安装rjava的真正噩梦。在macOS上安装xlsx和rJava Mavericks 10.9.5

我的设置：

MacOS 10.9.5 
Java: 7u71 (64 bits dowloaded from Oracle site) 
R: R version 3.1.1 (2014-07-10)

首先，在命令行我跑的

sudo R CMD javareconf

然后，我在'r跑：

install.packages('rJava')

在结束时的错误编译是这样的：

JavaVM -F/opt/local/Library/Frameworks/R.framework/.. -framework R -llzma -lm -liconv -licuuc -licui18n 
ld: library not found for -licuuc 
clang: error: linker command failed with exit code 1 (use -v to see invocation) 
make[2]: *** [libjri.jnilib] Error 1 
make[1]: *** [src/JRI.jar] Error 2 
make: *** [jri] Error 2 
ERROR: compilation failed for package ‘rJava’ 
* removing ‘/Users/costa/Library/R/3.1/library/rJava’

我试过Java 8和Mac默认的java，并且也得到了同样的错误。

Ideias？

我认为我必须安装雪豹构建和正常工作 – rawr 2014-11-05 11:57:05

我尝试使用此版本：http://support.apple.com/kb/dl1573但我无法安装（我的Mac是10.9.5） – Menthor 2014-11-05 21:08:16

“openxlsx”是一个不依赖于Java的不错选择。 https://github.com/cran/openxlsx – James 2015-12-08 16:08:36

答

我在我的电脑上出现了相同的错误（Mac OS 10.9.5，Java 1.8.0_11，R 3.1.1）。从Oracle（1.8.0_25）安装最新的Java JDK并没有解决问题（但）。但是，更新Java之后，安装R 3.1.2解决了我的问题。运行install.packages("rJava")后，这个工程：

> library("rJava") 
> .jinit() # this starts the JVM 
> s <- .jnew("java/lang/String", "Hello World!") 
> .jcall(s,"I","length") 
[1] 12

请注意，更新JDK是从Java版本不同的东西Java的GUI控制面板中，通过系统的喜好进行访问。后者仅用于互联网浏览器插件的JRE。

答

我所做的（使用MacPorts的R）为根（sudo的庆典）：

编辑 /opt/local/Library/Frameworks/R.framework/Resources/etc/Makeconf 和改线
```
LIBS = -llzma -lm -liconv -licuuc -licui18n 
```
到
```
LIBS = -llzma -lm -liconv 
```
安装原来的1.6 Mac Java
出口 JAVA_HOME=/System/Library/Java/JavaVirtualMachines/1.6.0.jdk/Contents/Home
运行R CMD javareconf

现在你可以开始R和做install.packages("rJava")。使用1.6版本的Java确保RStudio也可以加载rJava软件包。

如果不使用RStudio计划，你也可以使用Java 1.8

只为了改变'Makeconf'文件中的标志！另外，您可能需要使用'sudo'运行'R CMD javareconf'。 – 2017-07-24 15:20:57

答

我有同样的问题。我使用的是OS X Yosemite和最初有安装R 1至自制

我进行下面的步骤来解决这个问题：

关闭所有的R
在我的终端外壳的情况下，跑出sudo R CMD javareconf
从我的终端开辟了R和跑：

install_packages("rJava")

install_packages("xlsx")

答

使用旧的Java SE 6我能得到rJava运行javareconf如下编译：

JAVA_HOME=/Library/Java/JavaVirtualMachines/1.6.0.jdk/Contents/Home \ 
JAVA_CPPFLAGS=-I/Applications/Xcode.app/Contents/Developer/Platforms/MacOSX.platform/Developer/SDKs/MacOSX10.11.sdk/System/Library/Frameworks/JavaVM.framework/Versions/Current/Headers/ \ 
r CMD javareconf

答

我实际上是能够通过使用Mac二进制避免编辑我的环境完全在我的Macbook上安装rJava（运行OSX Yosemite和R版本3.2.3）。首先，请执行下列操作中的R安装rJava：

install.packages("rJava", type = "mac.binary")

想必此无关，因为某些原因，直到我第一次安装xlsxjars依赖我无法安装XLSX。 R：

install.packages(c("xlsxjars", "xlsx"))

并且使用这两个命令，xlsx似乎在Mac上安装得很好！

答

这为我工作：

sudo R CMD javareconf

然后，在R解释器：

install.packages('rJava', type='source') 
install.packages('xlsx', type='source')

在这个阶段，我得到了rJava的编译失败：install.packages（'rJava'，type ='source'） – 2017-06-22 14:07:07

在macOS上安装xlsx和rJava Mavericks 10.9.5

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