从Rprof获取更多信息（）
我一直在试图深入研究我编写的一些R代码中的时间，因此我使用的是Rprof。输出还不是非常有帮助的，但：从Rprof获取更多信息（）
> summaryRprof()
$by.self
self.time self.pct total.time total.pct
"$<-.data.frame" 2.38 23.2 2.38 23.2
"FUN" 2.04 19.9 10.20 99.6
"[.data.frame" 1.74 17.0 5.54 54.1
"[.factor" 1.42 13.9 2.90 28.3
...
是否有某种方式来深入挖掘和发现的$<-.data.frame哪些具体的调用，并FUN（这可能是从by()）等实际上是罪魁祸首？或者我需要重构代码并制作更小的功能块以获得更精细的结果？
我忍住重构的唯一原因是，我不得不将数据结构传递到功能，所有的传球是价值，因此这似乎是在错误的方向迈出的一步。
谢谢。
现有的CRAN包profr和proftools对此很有用。后者可以使用Rgraphviz，它不总是可以安装的。
的R Wiki page on profiling有额外的信息和罗曼一个很好的脚本，也可以可视化（但需要graphviz的）。
进行解析时Rprof生成输出是不是太硬，然后您可以访问绝对一切。
Rprof以时间间隔取样调用堆栈 - 这是个好消息。
我所要做的就是访问它收集的原始堆栈样本（stackshots），随机挑选几个并检查它们。我正在寻找的是呼叫站点（不只是函数，而是函数调用另一个函数的地方），它们出现在多个样本上。例如，如果呼叫站点出现在50％的样本上，那么这就是成本，因为它可能的去除将大约节省总时间的50％。 （似乎是显而易见的，对吧？但它不为人所熟知。）
并不是每一个代价高昂的调用的位置是优化的，但也有一些，除非方案已经尽可能快。如果某件事会为你节省一段合理的时间，那么它就会出现在相似的样本中，确切的数字并不会影响你的观点，重要的是你可以找到它，也不要被图表和递归以及时间测量和计数问题分散注意力，重要的是，对于你看到的每个调用站点，显示它的堆栈样本的一部分。）
网址被破坏，也许现在是[这里]（http://rwiki.sciviews.org/doku.php?id=tips:misc:profiling）。 – hhh 2011-04-08 00:36:00