STM：从DFM

问题描述：

启动时运行基于Quanteda的STM模型后估计元/主题关系DFM，我想估计对某些专题我的协变量的影响。STM：从DFM

运行STM模型运行正常，产生预期的主题，但是当使用estimateEffect（在下面的脚本的最后一步）时，R会话被中止，通知有一个'致命错误'。

我如何估计我的协变量的影响，从DFM启动时？ STM手册提供了从dfm运行STM模型的建议，但是我无法在此阶段后找到如何处理协变量。

下面的代码：

# Read texts with Quanteda 
texts <- (readtext("C:/Users/renswilderom/Documents/Stuff Im working on at the moment/Newspaper articles DJ/test data/*.txt", 
     docvarsfrom = "filenames", dvsep = "_", 
     docvarnames = c("Date of Publication", "Length LexisNexis", "source"), 
     encoding = "UTF-8-BOM")) 

mycorpus <- corpus(texts) 

tokens <- tokens(mycorpus, remove_punct = TRUE, remove_numbers = TRUE, ngrams = 1) 

mydfm <- dfm(tokens, remove = stopwords("english"), stem = TRUE) 


# Run the STM model - Metadata is called with 'data = docvars(mycorpus)' 
stm_from_dfm <- stm(mydfm, K = 10, prevalence =~ Date.of.Publication + source, gamma.prior='L1', data = docvars(mycorpus)) 

# Estimate effects 
prep <- estimateEffect(1:10 ~ Date.of.Publication + source, stm_from_dfm, 
         meta = docvars(mycorpus), uncertainty = "Global")

另外，我从我的DFM文集作出了STM语料库，利用STMcorpus <- asSTMCorpus(mydfm)。但后来我无法运行STM模型，因为它没有识别我的元数据。遵循这种替代策略会更好吗？（所以我需要在运行STMcorpus <- asSTMCorpus(mydfm)后以某种方式将元数据与STMcorpus相关联）。

这是很难没有重现的示例 - 你能提供一个诊断？另外，我认为当你做'asstMCorpus（mydfm）'时，quanteda包含了数据。元数据只是在一个名为'data' – bstewart

肯定列表中的对象，这里是我使用的实际报纸文章的一个样本：https://wetransfer.com/downloads/a50d8b8fd524359751e8aa68bac3256c20171016160720/3f3bb29e40362434594f44aeee1e67f720171016160720/b425d8 I'dd喜欢从'stm_from_dfm'工作，但如果需要的话，我当然也可以从'asSTMCorpus（mydfm）工作'。我只是试着通过list数据来访问元数据。 – Rens

我无法用你给我的数据样本复制你的错误。如果你想分享你打电话之前工作区的副本'estimateEffect（）'我可以尝试从那里 - 复制但除此之外没有太多而不能重现问题，我可以做的。 – bstewart

答

我们通过这个工作通过的电子邮件 - 但我会在这里回答为别人谁可能遇到某种形式的问题。

有一个在matrixStats包这导致R键与仅在Windows大矩阵崩溃的问题。错误和解决方案在此处详述：https://github.com/HenrikBengtsson/matrixStats/issues/104。此问题包含对问题的简单测试以及如何安装修复该问题的开发版本matrixStats的说明。这是版本matrixStats 0.52.2中的一个问题，大概可以通过下一个CRAN版本解决。

STM：从DFM

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