RPostgreSQL将多个CSV文件加载到Postgresql表中
我是使用Postgresql的新手,并且在填充使用多个* .csv文件创建的表时遇到问题。我首先在pgAdmin4中工作,然后决定在RPostgreSQL上工作,因为R是我的主要语言。RPostgreSQL将多个CSV文件加载到Postgresql表中
无论如何,我正在处理(现在)与30 csv文件位于一个文件夹中。全部具有相同的标题和通用结构,例如:
Y:/Clickstream/test1/video-2016-04-01_PARSED.csv
Y:/Clickstream/test1/video-2016-04-02_PARSED.csv
Y:/Clickstream/test1/video-2016-04-03_PARSED.csv
...等等。
我试图通过使用以下来自Parfait的RPostgresql特定答案加载所有csv文件。可悲的是,它没有奏效。我的代码如下规定:
library(RPostgreSQL)
dir = list.dirs(path = "Y:/Clickstream/test1")
num = (length(dir))
psql.connection <- dbConnect(PostgreSQL(),
dbname="coursera",
host="127.0.0.1",
user = "postgres",
password="xxxx")
for (d in dir){
filenames <- list.files(d)
for (f in filenames){
csvfile <- paste0(d, '/', f)
# IMPORT USING COPY COMMAND
sql <- paste("COPY citl.courses FROM '", csvfile , "' DELIMITER ',' CSV ;")
dbSendQuery(psql.connection, sql)
}
}
# CLOSE CONNNECTION
dbDisconnect(psql.connection)
我不理解,我得到了错误:
Error in postgresqlExecStatement(conn, statement, ...) :
RS-DBI driver: (could not Retrieve the result : ERROR: could not open file
" Y:/Clickstream/test1/video-2016-04-01_PARSED.csv " for reading: Invalid
argument
)
如果我理解正确的,有我的第一个文件名无效参数。我对此不太确定,但我最近又在R中使用了PostgreSQL和这个RPostgreSQL。任何帮助都将非常感谢。
在此先感谢!
编辑:我发现问题,但由于某种原因无法解决问题。当我复制,而在for循环的路径:
# IMPORT USING COPY COMMAND
sql <- paste("COPY citl.courses FROM '",csvfile,"' DELIMITER ',' CSV ;")
我有以下结果:
sql
[1] "COPY citl.courses FROM ' Y:/Clickstream/test1/video-2016-04-01_PARSED.csv ' DELIMITER ',' CSV ;"
这意味着无效的参数是文件路径之间的空白。我试图改变这个失败。任何帮助将深表感谢!
尝试一些像服务器这样
Files <- list.files("Y:/Clickstream/test1", pattern = "*.csv", full.names = TRUE)
CSVs <- lapply(Files, read.csv)
psql.connection <- dbConnect(PostgreSQL(),
dbname="coursera",
host="127.0.0.1",
user = "postgres",
password="xxxx")
for(i in 1:length(Files)){
dbWriteTable(psql.connection
# schema and table
, c("citl", "courses")
, CSVs[i]
, append = TRUE # add row to bottom
, row.names = FALSE
)
}
嗨JackStat。感谢您的回答。我试图避免加载R中的文件,因为它们合计11千兆字节(仅用于测试文件夹)。如果他们不那么“沉重”,你的代码肯定会适合我的情况。我的意图是在psql中加载文件以使事情更快。再次,非常感谢! – lescobedo21
1. COPY命令运行和文件也必须是在服务器上。 2.请检查文件权限 - 必须允许阅读'postgres'用户 –
Hi Roman。非常感谢您的评论。恐怕我对psql不是很熟悉,所以我在理解你的2个答案时遇到了一些麻烦。请纠正我,如果我错误解释他们:1)你的意思是在服务器上的文件?实际上,我的所有文件都在服务器上,但它们尚未装载到psql中。 2)我是超级用户,在我的数据库中拥有所有权利。我在我的文件所在的服务器上也有管理权限。 – lescobedo21