调用从MPI进程调用MPI进程的脚本

Question

我有一个MPI程序（Fortran，MPICH），我需要将其从shell脚本中提取出来，该脚本依次启动自己的MPI程序（使用mpirun）。到目前为止，我已经将shell（system）命令包装在if(system_num .eq. root_system_num)事件中，所以只有一个MPI进程运行脚本。但是，这会导致一系列HYDU_create_process错误。

我认为使用MPI_Comm_spawn但也有像“MPI不说，如果你启动的程序是一个shell脚本和shell脚本启动调用MPI_INIT程序会发生什么”，所以这似乎不太理想，以及警告。

几点：

• 称为shell脚本并不需要在所有调用程序进行交互的程序。调用程序只需等待该过程完成即可。
• 将shell脚本转换为单独的可执行文件（很多环境变量设置，等等）并不容易。
• 理想情况下，这应该适用于MPICH和Open MPI。

有没有办法做到这一点？

Answer 1

对于MPICH，不幸的是，您最好使用MPI_Comm_spawn。你唯一的选择是在调用嵌套的MPI程序之前，找出所有依赖于实现的依赖于版本的环境变量，这些变量在shell脚本中需要为unset。 （对于MPICH）一些示例变量将包括PMI_RANK和PMI_PORT：

% mpiexec -n 1 env | egrep '^PMI|^HYD' 
HYDI_CONTROL_FD=8 
PMI_RANK=0 
PMI_FD=7 
PMI_SIZE=1 

显然，不同的变量将需要重组后开放MPI或不同版本MPICH2/MPICH的。