从java中调用R语言/脚本

问题描述：

我们如何从java调用R语言/ R脚本？基本上我需要围绕R脚本的Java包装。从java中调用R语言/脚本

数据将给予的java层说方法使用setData（双[]），其应反过来发送至R脚本 - 让我们说setDataR（双[]）方法。
R脚本将执行一些计算说调用方法double [] computeR（）。
Java程序将通过调用double [] getData（）来获得计算结果，该函数依次委托给R脚本来获取计算的数据。

这怎么能由JRI，Rserv，Rcaller进行？我没有看到任何方式来调用Rscript方法？请寄样品。它应该与JNI（java，C++）调用相似。

在jvm中，我认为多个线程无法调用R脚本调用正确吗？任何工作？

感谢

删除评论。 – nograpes

答

从Java使用R本最简单的办法是使用Runtime.exec("")，抓住了响应，并解析它。有关如何运行原生指令的典型例子是：

Process p = Runtime.getRuntime().exec("ls"); 
BufferedReader stdInput = new BufferedReader(new InputStreamReader(p.getInputStream())); 
BufferedReader stdError = new BufferedReader(new InputStreamReader(p.getErrorStream()));

从这里，你可以阅读和处理打印到标准输出结果被缓存到stdInput。

此操作需要额外的字符串解析过程，该过程已由RCaller处理。 – jbytecode

答

RCaller准确地做你想做的。假设你有一个双阵列“A”被定义为

double[] a = new double[] {1.0, 2.0, 3.0};

，你要计算的平均数，中位数和标准偏差值。创建一个RCaller的新实例

RCaller caller = new RCaller(); 
Globals.detect_current_rscript(); 
caller.setRscriptExecutable(Globals.Rscript_current); 

RCode code = new RCode(); 


code.addDoubleMatrix("a", a); 
code.addRCode("s <- list(mean=mean(a), median=median(a), sd=sd(a))"); 

caller.setRCode(code); 

caller.runAndReturnResult("s"); 

double mean = caller.getParser().getAsDoubleArray("mean")[0]; 
double median = caller.getParser().getAsDoubleArray("median")[0]; 
double sd = caller.getParser().getAsDoubleArray("sd")[0];

并且变量中位数保存从R脚本返回的值2.0。详情请参阅here

从java中调用R语言/脚本

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