R igraph：按列内容的颜色顶点

Question

我使用igraph绘制SQL Server的图形。我提供作为输入的3列的表格：

from to  color 
Node1 NodeA red 
Node1 NodeB green 
Node1 NodeC blue 
Node2 NodeD red 
Node2 NodeE green 

我的[R脚本是这样的：

require(igraph) 
g <- graph.data.frame(graphdf) 
V(g)$label.cex <- 2 
png(filename = "'[email protected]+'", height = 3000, width = 3000, res = 100); 
plot(g, vertex.label.family = "sans", vertex.size = 5) 
dev.off() 

该地块的边缘将显示所需的颜色，但顶点自己不会做 - 理想，我希望'to'顶点是'color'列中指定的颜色。我不在乎'从颜色（它可以是默认的橙色）。

我试着添加此（和变化）：

V(g)$color <- graphdf[V(g), 3] 

巴新前行，但生产什么似乎是随机的顶点颜色。

Answer 1

这取决于你如何创建你的graphdf。列是字符串还是因素？我将针对这两种情况展示解决方案。

graphdf包含字符串

library(igraph) 

## Create data 
graphdf = read.table(text="from to  color 
Node1 NodeA red 
Node1 NodeB green 
Node1 NodeC blue 
Node2 NodeD red 
Node2 NodeE green", 
header=TRUE, stringsAsFactors=FALSE) 
g <- graph.data.frame(graphdf) 

我会让所有的节点是橙色，但后来调整色调为目的节点。

## Make default color orange 
V(g)$color = "orange" 
V(g)[graphdf$to]$color = graphdf$color 

graphdf包含的因素

的混乱情况是，如果你允许所有的字符串，成为因素。唯一的区别是，您在使用它们时必须将as.character应用于所有因素。

graphdf = read.table(text="from to  color 
Node1 NodeA red 
Node1 NodeB green 
Node1 NodeC blue 
Node2 NodeD red 
Node2 NodeE green", 
header=TRUE) 
g <- graph.data.frame(graphdf) 

V(g)$color = "orange" 
V(g)[as.character(graphdf$to)]$color = as.character(graphdf$color) 
plot(g)