读取多个csv文件并获取每个csv文件的文件名在R

读取多个csv文件并获取每个csv文件的文件名在R

问题描述:

我想读取多个csv文件并使用ggplot为每个文件做一些绘图。我想用每个输入文件的文件名打印数字。每个csv文件有6列,但Im只绘制1,2,5,6列。读取多个csv文件并获取每个csv文件的文件名在R

我有一个代码,但仅适用于一个CSV文件:

dat<-read.csv("D135_tmin.csv",header=TRUE) 
    dat$Year<-seq(ymd('1991-01-01'),ymd('2000-12-31'),"days") 
    dat2 <- dat[,c(1,2,5,6)] 
    names(dat2)[3:4] <- c("P10","P90") 
    dat2 <- melt(dat2,id.vars="Year") 
    ggplot(dat2[dat2$variable=="Tmin",],aes(Year,value))+ 
    geom_line(linetype="dashed",color="black",size=0.25)+ 
    geom_point(data=dat2,aes(Year,value,grp=variable,fill=variable),pch=21,size=2)+ 
    scale_fill_manual(name="Legend",values=c("Tmin"="dark slate blue","P90"="green","P10"="orange")) 
    dev.print(pdf, file="D135_tmin.pdf") 

当读取多个CSV文件,我使用以下命令:

 temp=list.files(pattern="*.csv") 
    myfiles=lapply(temp,read.table,header=TRUE) 

我的问题是,我会读100个csv文件和输出pdf应该与输入的csv文件具有相同的名称。

有什么建议吗?

+0

在你的'lapply'运行'setNames(myfiles,temp)' – Benjamin

是否有你不想使用for循环的原因?你可以这样做:

for (i in list.files(pattern="*.csv"){ 
    dat <- read.csv(i) 
    dat$Year<-seq(ymd('1991-01-01'),ymd('2000-12-31'),"days") 
    dat2 <- dat[,c(1,2,5,6)] 
    names(dat2)[3:4] <- c("P10","P90") 
    dat2 <- melt(dat2,id.vars="Year") 
    ggplot(dat2[dat2$variable=="Tmin",],aes(Year,value))+ 
      geom_line(linetype="dashed",color="black",size=0.25)+ 
    geom_point(data=dat2,aes(Year,value,grp=variable,fill=variable), 
     pch=21,size=2)+ 
     scale_fill_manual(name="Legend",values= 
     c("Tmin"="dark slate blue","P90"="green","P10"="orange")) 
    dev.print(pdf, file=sub("csv", "pdf", i)) 
} 
+0

很多非常感谢你的建议 – Liliputian