读取多个csv文件并获取每个csv文件的文件名在R
问题描述:
我想读取多个csv文件并使用ggplot为每个文件做一些绘图。我想用每个输入文件的文件名打印数字。每个csv文件有6列,但Im只绘制1,2,5,6列。读取多个csv文件并获取每个csv文件的文件名在R
我有一个代码,但仅适用于一个CSV文件:
dat<-read.csv("D135_tmin.csv",header=TRUE)
dat$Year<-seq(ymd('1991-01-01'),ymd('2000-12-31'),"days")
dat2 <- dat[,c(1,2,5,6)]
names(dat2)[3:4] <- c("P10","P90")
dat2 <- melt(dat2,id.vars="Year")
ggplot(dat2[dat2$variable=="Tmin",],aes(Year,value))+
geom_line(linetype="dashed",color="black",size=0.25)+
geom_point(data=dat2,aes(Year,value,grp=variable,fill=variable),pch=21,size=2)+
scale_fill_manual(name="Legend",values=c("Tmin"="dark slate blue","P90"="green","P10"="orange"))
dev.print(pdf, file="D135_tmin.pdf")
当读取多个CSV文件,我使用以下命令:
temp=list.files(pattern="*.csv")
myfiles=lapply(temp,read.table,header=TRUE)
我的问题是,我会读100个csv文件和输出pdf应该与输入的csv文件具有相同的名称。
有什么建议吗?
答
是否有你不想使用for
循环的原因?你可以这样做:
for (i in list.files(pattern="*.csv"){
dat <- read.csv(i)
dat$Year<-seq(ymd('1991-01-01'),ymd('2000-12-31'),"days")
dat2 <- dat[,c(1,2,5,6)]
names(dat2)[3:4] <- c("P10","P90")
dat2 <- melt(dat2,id.vars="Year")
ggplot(dat2[dat2$variable=="Tmin",],aes(Year,value))+
geom_line(linetype="dashed",color="black",size=0.25)+
geom_point(data=dat2,aes(Year,value,grp=variable,fill=variable),
pch=21,size=2)+
scale_fill_manual(name="Legend",values=
c("Tmin"="dark slate blue","P90"="green","P10"="orange"))
dev.print(pdf, file=sub("csv", "pdf", i))
}
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很多非常感谢你的建议 – Liliputian
在你的'lapply'运行'setNames(myfiles,temp)' – Benjamin