《MICCAI2019》Integrating cross-modality hallucinated MRI with CT to aid mediastinal lung tumor segmen

预备知识:

  1. CT缺乏对医学影像的软组织对比度的信息,这也使得在肿瘤边界的划分以及可视化方面变得困难
  2. CT中部分难以被解释的特征,在CT学习提取MR图像信息的时候可以用来提供推断信息
  3. CycleGAN思想:
    《MICCAI2019》Integrating cross-modality hallucinated MRI with CT to aid mediastinal lung tumor segmen
    GANCycleGAN在我理解就是一个X->Y的单向GAN+Y->X的单向GAN,包括两个生成器G,F以及两个判别器Dx,Dy,在loss function上,一个GAN包括两个loss function,分别为生成器和判别器的,以及最后生成的x’和真实x之间需要保证相似性的loss function:cycle-consistency loss
    所以Cycle中包括5个loss function
    想法总结:
    CT缺点:软组织对比度低
    MR优点:包含了很好的软组织对比度信息
    因此文章核心:提出一种基于CycleGAN的交叉模式的学习方法(CMDEL:cross-modality enduced deep learning),个人理解与多模态学习类似。
    网络实现想法:
    《MICCAI2019》Integrating cross-modality hallucinated MRI with CT to aid mediastinal lung tumor segmen
  4. 从CT中提取MR信息
    利用CycleGAN的思想:
    第一步通过CT生成伪MR图像(图a上半部分图像)
    第二步将生成的伪MR图像和真实的MR图像同时输入到第二个GAN网络中得到输出伪CT图像(图a下半部分图像)
    第三步将生成的伪CT图像作为输入也输入到第一步中的GAN中
    同时为了保证我们从CT当中提取到的伪MR信息和真实的MR信息具有相似性,文章另外采用VGG-19来对伪MR和MR进行训练,使得能够保存上下文的相似性,从而能够保证提取到的伪MR信息是能够真是反映MR信息的(图b上半部分图像)
  5. 利用提取的信息作为辅助分割来改善CT的分割结果,网络文章中提到使用U-Net以及Dense-FCN(图b下半部分图像)
    Loss function:
    Dx+Dy的判别器的标准loss function
    《MICCAI2019》Integrating cross-modality hallucinated MRI with CT to aid mediastinal lung tumor segmen
    CycleGAN中生成的伪图像和输入的真实图像之间的loss function
    《MICCAI2019》Integrating cross-modality hallucinated MRI with CT to aid mediastinal lung tumor segmen
    Lcx:最后从CT中提取的伪MR信息和真实的MR信息之间需要保证相似度loss function
    Lseg:图像分割的loss function《MICCAI2019》Integrating cross-modality hallucinated MRI with CT to aid mediastinal lung tumor segmen

总结:
文章采用了四个网络,分别为
一个CycleGAN(包括两个GAN)从CT中提取MR图像,注意:此处CT和MR不需要配对
一个VGG-19保证生成的伪MR图像与真实MR图像的相似性
一个U-Net/Dense-FCN作为CT分割的网络