Python3上安装minepy包和使用方法踩过的坑

1.minepy简介

        minepy为基于最大信息系数(MIC和MINE族)提供了一个库。主要特点如下:

• APPROX-MIC
• 一个ANSI C库
• 一个c++接口;
• 一个高效的Python API (兼容python2和3);
• 一个高效的MATLAB/OCTAVE API;

     由于MINE是一个开源的应用，在官网上给出的原话如下：

MINE可以通过上述三种形式下载，由于我想用python实现MIC计算，所以用minepy。

2.minepy的安装

安装minepy前先装好python3.7，然后在命令行安装之前必须先装下面两种包，不然会报错：（1）minepy.whl，它的官网地址：Unofficial Windows Binaries for Python Extension Packages，按照自己电脑上装的python版本和位数找到对应项。听说MIC算法只支持32位的python，所以我安装了32位的python3.7，对应选择如下的minepy.whl。

找到该文件下载的位置，然后DOS命令进入到该目录下，执行安装：pip install minepy-1.2.2-cp37-cp37m-win32.whl 等待安装完成即可。

（2）还需安装matplotlib包，因为python中不自带这种库。命令行执行：pip install matplotlib 等待安装完成即可。

3.小实例验证下MINE能否使用

写一段python代码，并执行它如下：

import numpy as np
from minepy import MINE
import matplotlib.pyplot as plt

def print_stats(mine):
    print ("MIC"), mine.mic()
x = np.linspace(0, 1, 1000)
y = np.sin(10 * np.pi * x) + x
mine = MINE(alpha=0.6, c=15)
mine.compute_score(x, y)
plt.scatter(x, y,  color='black')
plt.show()
print ("Without noise:")
print_stats(mine)
print  np.random.seed(0)
y +=np.random.uniform(-1, 1, x.shape[0]) # add some noise
plt.scatter(x, y,  color='black')
plt.show()
mine.compute_score(x, y)

print ("With noise:")
print_stats(mine)
 

代码来自：https://zhuanlan.zhihu.com/p/53092905

python中运行结果如下图，得出一个无噪声的正弦函数

 

在下图中点越密集的地方说明相关性越大，图中的每一个点对应一个坐标值，在原始运行图上可查看。下图位一个有噪声的正弦函数。

实例能成功运行说明我们的MINE是可以用来计算出MIC值。