2020.11.18丨Multiqc使用对多样本数据进行统计
- 平时做一些项目，在样品不多的情况下，使用fastqc，可以对每个样品单独生成质控报告。然而，当遇到群体遗传相关的项目、样本数量比较多的时候，则需要统计所有样品生成汇总表，方便观察各样品质控结果。因此我们选择使用Multiqc来对结果进行汇总。
- 使用软件：Multiqc
- 安装说明：
- 官方下载：Release MultiQC Version 1.9 · ewels/MultiQC · GitHub
- code：
- gunzip MultiQC-1.9.tar.gz
- tar -vzf MultiQC-1.9.tar
- cd MultiQC-1.9
- python setup.py install
- multiqc --version#multiqc, version 1.9
- code：
- conda: conda install -c bioconda multiqc
- 目前其他博客提到的使用conda的方式我这里没有成功，大家也可以试试
- 官方下载：Release MultiQC Version 1.9 · ewels/MultiQC · GitHub
- 使用说明：
- multiqc /home/project/fastqc_result -o home/project/multiqc_result
- 结果展示
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