利用Excel处理OTU表

1 OTU表数据一维化（使用excel2016版本以上）

现在的数据有2个维度，OTU和样本，接下来我们要把维度降低到一维，只保留OTU这个维度，原样本信息以数据标签的形式标注在值的后面。

选择数据→从表格，这里会打开一个查询编辑器

将第一行设置为列名，选中第一列和最后一列，点转换，逆透视其他列

现在数据全都在一列了，原样本信息在属性列

开始→关闭并上载，

修改一下C列名称为sampleID后，新建一个sheet，将样本分组等信息录入

回到刚刚上载的数据表，在值列后面新建2列，protocol和goat，在protocol列任意一单元格内输入“=VLOOKUP([@sampleID], Sheet1!$A:$C,2,0)”，在goat列任意一单元格内输入“=VLOOKUP([@sampleID], Sheet1!$A:$C,3,0)”，得到这样一个表

接下来把物种注释信息拆分，选中OTUConTaxonomy列，剪切到最后一列，数据→分列，分隔符号选分号，完成

将列名分别命名为k,p,c,o,f,g,s，代表界门纲目科属种7个水平的注释结果

选中A1单元格，插入→数字透视表，将值2放入值框中，修改为求和项，将k放入列中，可见15个样本一共有479449条序列

接下来我们直接看属水平的注释结果，将g项放入列，删除k项。行中放入protocol.

点击列标签下三角，选其他排序选项，选中降序，改为求和项：值2

这里显示的的是序列的数量，我们可以修改成显示比例，选择求和项：值2下三角，值字段设置，值显示方式→行汇总的百分比

现在数据显示为相对丰度，且按照从大到小的顺序排列

现在想更直观的看一下数据，就要打开数据透视图，选择百分比堆积柱形图

直观的一看，处理还是很明显的

接下来我们要看一下处理对同一动物影响是不是一致的，将goat项放入行框中

结果还是相当的一致，YM处理降低了蓝色真菌（g__Orpinomyces）和橙色真菌（g__Caecomyces），对每个动物的的影响是一致的。结果怎么样，要导出结果用统计软件统计后才知道，下面整理数据。首先修改透视表的显示方式为列表，清除所有的汇总结果，并重复所有项目标签

将所有的样品信息内容放入行中，就得到以下表格，直接导出就可以进行统计分析了