荧光显微镜中斑点检测方法的定量比较读后总结

论文内容简介:

生物图像数据的定量分析通常涉及许多亚分辨率斑点的检测,尤其是使用荧光显微镜的活细胞成像中,信噪比(SNR)可能非常低,这使得自动点检测成为一项非常艰巨的任务,过去已经有许多方法用来检测斑点,但没有人对这些方法进行全面的评估比较,本文尝试了7种无监督检测方法和2种有监督检测方法,在低SNR的检测中,机器学习方法的整体效果最佳,基于形态学的h-dome变换和多尺度方差稳定化变换与其相差无几,在高SNR时,所有算法的效果相差无几。

荧光显微镜中斑点检测方法的定量比较读后总结

斑点检测的算法步骤:
荧光显微镜中斑点检测方法的定量比较读后总结
图像处理第一步:去噪

1)Gaussian Smoothing(高斯平滑)
2)Isotropic Undecimated Wavelet Denoising
3)Patch-Based Denoising
4)Variance-Stabilizing Techniques
没错,我就只认识第一个。。后面的之后再查论文看怎么回事吧。

图像处理第二步:无监督图像增强
1)Wavelet Multiscale Product
2)Multiscale Variance-Stabilizing Transform Detector
3)Top-Hat Filter
4)Spot-Enhancing Filter
5)Grayscale Opening Top-Hat Filter
6)H-Dome Based Detection
7)Image Features Based Detection

图像处理第二步:监督图像增强
1)AdaBoost
2)Fisher Discriminant Analysis

图像处理第三步:Signal Thresholding and Performance Measures

按照阈值对图像进行二值化,得到感兴趣的区域。

之后就是算法判别,首先是实现问题吧,我会开一个小专栏,用于存放这篇文章之后的复制实现,平台暂时选择matlab,因为编程能力有限,不得不这么做。