u-net对3D医学图像多类分割
u-net protate seg
对前列腺3D图像进行三分类分割
数据预处理
对于nii文件可以直接使用simpleitk包对图像进行读取显示,第一选择制作npy文件进行处理;第二直接读取显示保存为uint8图像,后续进行处理,前后两种方法需要图像标签以以对应;本文选择第二种方法,nii3D_dataset_generate.py脚本文件,批量处理nii文件。
u-net文件
unet模型左部分由VGG构成,train_model训练模型,config.py设置模型训练参数;datas文件存放数据;
训练结果
使用predict.py