u-net对3D医学图像多类分割

u-net protate seg

对前列腺3D图像进行三分类分割

数据预处理

对于nii文件可以直接使用simpleitk包对图像进行读取显示,第一选择制作npy文件进行处理;第二直接读取显示保存为uint8图像,后续进行处理,前后两种方法需要图像标签以以对应;本文选择第二种方法,nii3D_dataset_generate.py脚本文件,批量处理nii文件。

u-net文件

unet模型左部分由VGG构成,train_model训练模型,config.py设置模型训练参数;datas文件存放数据;

训练结果

使用predict.py

测试图片

u-net对3D医学图像多类分割

预测背景图片

u-net对3D医学图像多类分割

预测第一类图片

u-net对3D医学图像多类分割

预测第二类图片

u-net对3D医学图像多类分割

预测效果图

u-net对3D医学图像多类分割
github代码,记得加star