八大常用外泌体数据库汇总介绍

外泌体是胞内多泡体与细胞膜融合后,释放到细胞外的膜性小囊泡,是细胞间信号传输的载体。2013年,诺贝尔生理学或医学奖授予了三位科学家,表彰其在细胞间囊泡运输调控机制领域作出突出贡献,将外泌体研究的热度推向高潮。由于在临床上的巨大应用价值,近几年外泌体成为科研热点,相关论文发表数量呈爆炸式增长。

 

 

也许很多老师苦于外泌体研究如此火爆却无从介入

 

 

其实,外泌体就是一种特殊的研究对象,几乎所有生物医药研究领域,都可以全新的视角从外泌体角度深入挖掘,给自己的研究锦上添花!帮大家盘一盘外泌体数据库,看看您是不是可以从这些数据库中找到一些灵感和研究基础。

 

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 ExoCarta数据库(网址见文末)

 

八大常用外泌体数据库汇总介绍

ExoCarta是首个外泌体标志物综合数据库,由小恩家首席科学家Simpson教授团队建立,是一个开放的数据库平台,收录了包括人、大鼠、小鼠、绵羊、豚鼠、果蝇、马、穴兔、牛在内的几个物种共286个研究结果;涉及到不同组织器官来源的外泌体蛋白,mRNA,miRNA,脂类等信息。ExoCarta数据库的典型特点就是具有外泌体蛋白动态的蛋白与蛋白之间相互关系网以及生物学通路。用户可以从大量的研究中下载最常用的蛋白数据。下载的文件可直接导入FunRich工具,进行其他的功能富集和相互关系网分析。该数据库已经被超过16000名独立研究人员使用。

 

 

2

 

exoRBase(网址见文末)

 

八大常用外泌体数据库汇总介绍

exoRBase是人类血液外泌体长链RNA-seq数据库,同时也包括已发表文献的实验验证。(51xxziyuan.com整理)该数据库目前共收录92例血液样本,58330个circRNA、15501个LncRNA和18333个mRNA,并提供了注释、表达水平和可能的来源组织。exoRBase主要特点是对标准化RNA-seq数据的RNA表达谱进行了整合和可视化。数据涵盖了健康对照者32例,冠状动脉心脏疾病(CHD)6例,结肠癌(CRC)12例,肝细胞癌(HCC)21例,胰腺腺癌(PAAD)14例,乳腺癌2例。

 

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