在移动窗口numpy数组上有效地应用函数
问题描述:
我有大约100,000个二维数组,我需要应用本地过滤器。两个尺寸的尺寸都是一样的,而且窗口已经超过了2×2的尺寸,并进一步移动了2个,这样每个元素都会在窗口中显示一次。输出是一个相同大小的二进制二维数组,我的过滤器也是一个二进制2×2块。我的过滤器的0部分将映射到0,我的过滤器部分是1全部映射到1,如果它们具有相同的值,并且映射到0,如果它们不完全相同。这里有一个例子:在移动窗口numpy数组上有效地应用函数
Filter: 0 1 Array to filter: 1 2 3 2 Output: 0 1 0 0
1 0 2 3 3 3 1 0 0 0
我当然可以使用双for循环做然而,这是非常低效的,并必须有一个更好的办法。我读到这个:Vectorized moving window on 2D array in numpy但是我不确定我会如何将它应用于我的案例。
答
您可以拆分每个2x2
子阵列,然后重新塑形,使每个加窗块成为2D
阵列中的一行。 从每一行中,使用boolean indexing
提取出对应于f==1
职位的元素。 然后,看看是否所有提取的元素沿着每一行是相同的,给我们一个面具。重塑后,使用此掩码与f
乘以最终的二进制输出。
因此,假设f
作为滤波器阵列和A
作为数据阵列,量化执行遵循这样的步骤是这样的 -
# Setup size parameters
M = A.shape[0]
Mh = M/2
N = A.shape[1]/2
# Reshape input array to 4D such that the last two axes represent the
# windowed block at each iteration of the intended operation
A4D = A.reshape(-1,2,N,2).swapaxes(1,2)
# Determine the binary array whether all elements mapped against 1
# in the filter array are the same elements or not
S = (np.diff(A4D.reshape(-1,4)[:,f.ravel()==1],1)==0).all(1)
# Finally multiply the binary array with f to get desired binary output
out = (S.reshape(Mh,N)[:,None,:,None]*f[:,None,:]).reshape(M,-1)
样品运行 -
1)输入:
In [58]: A
Out[58]:
array([[1, 1, 1, 1, 2, 1],
[1, 1, 3, 1, 2, 2],
[1, 3, 3, 3, 2, 3],
[3, 3, 3, 3, 3, 1]])
In [59]: f
Out[59]:
array([[0, 1],
[1, 1]])
2)中间体输出:
In [60]: A4D
Out[60]:
array([[[[1, 1],
[1, 1]],
[[1, 1],
[3, 1]],
[[2, 1],
[2, 2]]],
[[[1, 3],
[3, 3]],
[[3, 3],
[3, 3]],
[[2, 3],
[3, 1]]]])
In [61]: S
Out[61]: array([ True, False, False, True, True, False], dtype=bool)
3)最终输出:
In [62]: out
Out[62]:
array([[0, 1, 0, 0, 0, 0],
[1, 1, 0, 0, 0, 0],
[0, 1, 0, 1, 0, 0],
[1, 1, 1, 1, 0, 0]])
相同的方法可以用做'np.kron(〜np.any(np.diff(A4D [...,F == 1]), -1),f)';-) – 2016-05-30 09:22:31
@morningsun啊是在最后一步乘法的'kron'!谢谢! – Divakar