为逻辑回归绘制多个拟合和预测
问题描述:
我对从数据集中提取的1000多个样本进行多次逻辑回归运行。我的问题是展示我的结果的最佳方式是什么?我如何绘制适合度和预测曲线的输出?为逻辑回归绘制多个拟合和预测
这是我正在做的一个例子,使用R的棒球数据集。例如,我想拟合和预测模型5次。每次我拿出一个样本(用于预测)并使用另一个样本进行拟合。
library(corrgram)
data(baseball)
#Exclude rows with NA values
dataset=baseball[complete.cases(baseball),]
#Create vector replacing the Leage (A our N) by 1 or 0.
PA=rep(0,dim(dataset)[1])
PA[which(dataset[,2]=="A")]=1
#Model the player be league A in function of the Hits,Runs,Errors and Salary
fit_glm_list=list()
prd_glm_list=list()
for (k in 1:5){
sp=sample(seq(1:length(PA)),30,replace=FALSE)
fit_glm<-glm(PA[sp[1:15]]~baseball$Hits[sp[1:15]]+baseball$Runs[sp[1:15]]+baseball$Errors[sp[1:15]]+baseball$Salary[sp[1:15]])
prd_glm<-predict(fit_glm,baseball[sp[16:30],c(6,8,20,21)])
fit_glm_list[[k]]=fit_glm;prd_glm_list[[k]]=fit_glm
}
答
这里有很多问题。
-
PA
是baseball$League
一个子集,但是该模型构造上的列从整个baseball
数据帧,即它们不匹配。 -
PA
在使用默认系列(高斯)时被视为连续响应,应将其更改为因子和二项系列。 -
prd_glm_list[[k]]=fit_glm
应该可能是prd_glm_list[[k]]=prd_glm
- 您必须保存预测的真实类标签,否则您无法比较。
我对你的代码看起来像这样。
library(corrgram)
data(baseball)
dataset <- baseball[complete.cases(baseball),]
fits <- preds <- truths <- vector("list", 5)
for (k in 1:5){
sp <- sample(nrow(dataset), 30, replace=FALSE)
fits[[k]] <- glm(League ~ Hits + Runs + Errors + Salary,
family="binomial", data=dataset[sp[1:15],])
preds[[k]] <- predict(fits[[k]], dataset[sp[16:30],], type="response")
truths[[k]] <- dataset$League[sp[1:15]]
}
plot(unlist(truths), unlist(preds))
模型表现不佳,但至少代码运行没有问题。在图中的y轴示出了估计概率,这些实施例属于联赛N,即理想左框应接近0和右接近1
哪里是“棒球“数据集? – 2013-04-28 16:39:19
@ A.R你是什么意思的“显示我的结果”?绘制预测的分布?绘制残差?绘制其他回归诊断?还有别的吗? – pteetor 2013-04-28 16:50:25
@pteetor绘制预测和残差的分布 – 2013-04-28 16:55:43