for循环回显顺序命令行?
问题描述:
如何在linux中使用for循环来生成以下几行?for循环回显顺序命令行?
zcat ~/tools/sample66621D.fastq | bowtie2 -a - | samtools ->sample66621D.BAM
zcat ~/tools/sample66622D.fastq | bowtie2 -a - | samtools ->sample66622D.BAM
zcat ~/tools/sample66623D.fastq | bowtie2 -a - | samtools ->sample66623D.BAM
我已经试过:
for ((a=21;a<=23;a++))
echo "zcat ~/tools/sample666$aD.fastq | bowtie2 -a - | samtools ->sample666$aD.BAM"
done
却原来是三个相同的线。
zcat ~/tools/sample666.fastq | bowtie2 -a - | samtools ->sample666.BAM
zcat ~/tools/sample666.fastq | bowtie2 -a - | samtools ->sample666.BAM
zcat ~/tools/sample666.fastq | bowtie2 -a - | samtools ->sample666.BAM
感谢
答
$aD
是一个有效的变量名。您必须用括号将变量名称分隔,即${a}
。
谢谢,它的工作原理。把这些echo命令行输出到run.sh文件怎么样? - >在这里没有工作。 – Ming