根据文件名列表从目录中的文件打印一些行

问题描述：

我试图从基于正则表达式的目录中的许多文件打印特定的行。我有一个文件名列表和一个包含这些文件的目录。我只能弄清楚如何打印目录中所有文件的行。但我需要的只是来自filename.txt列表中文件的打印行。根据文件名列表从目录中的文件打印一些行

for f in ForPAML/*.paml; do grep -m 1 'Mm10' "$f"; done

我用上面的命令来打印目录中所有文件都有Mm10的行。

FILENAME.TXT样子：

Mus_Rn5_.02.aa.fa.afa.paml 
Mus_Rn5_.03.aa.fa.afa.paml 
Mus_Rn5_.04.aa.fa.afa.paml 
Mus_Rn5_.07.aa.fa.afa.paml

而且该目录包含这些文件加上许多。

而文件Mus_Rn5_.03.aa.fa.afa.paml例如看起来像这样。

2  54 
Mm10-chr19:41729055-41729126 
ACACTCGAAGCTGCTGGCCAGCAAAGTCATTCTTGTGGATCCGAGTGTTGTTGC 
1:268429604-268429675 
ACACTCGAAGCTGCTGCCCAGCAAAGTCATTCTTATGGATCCGAGTATTGTTAC

我需要打印包含“MM10”与文件名到一个新的文件一起行。事情是这样的 Mus_Rn5_.02.aa.fa.afa.pamlMm10-chr19:41729055-41729126 Mus_Rn5_.03.aa.fa.afa.pamlMm10-chr11:34068938-34068969 Mus_Rn5_.04.aa.fa.afa.pamlMm10-chr11:34069868-34069905

...

此外，文件的目录中的数量实在是太多了，所以我结束了“参数列表太长”的错误，那就是原因我使用了'for'循环似乎工作。

前缀代码/数据有四个空格。请看[编辑帮助]（http://stackoverflow.com/editing-help）。 – Cyrus

答

您可以使用xargs的和awk：

xargs -a filename.txt awk '/Mm10/ { print FILENAME, $0 }' > results.txt

这工作！谢谢。 – user210432

根据文件名列表从目录中的文件打印一些行

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